📄 systems biology

Multicomplex Integrative Structural Modeling of a Human Histone Deacetylase Interactome

यह अध्ययन NuRD, SIN3 और CoREST परिसरों के भीतर HDAC1/2 के संयोजन तंत्र को स्पष्ट करने के लिए क्रॉसलिंकिंग मास स्पेक्ट्रोमेट्री और AlphaFold को संयोजित करते हुए एकीकृत संरचनात्मक मॉडलिंग का उपयोग करता है, जो यह प्रकट करता है कि HDAC1 का अंतर्निहित अव्यवस्थित C-टर्मिनल डोमेन कॉम्प्लेक्स निर्माण के समय अल्फा हेलिसेस में फोल्ड हो जाता है।

Nde, J., Majila, K., Zimmermann, R., Kempf, C., Zhang, Y., Cesare, J., Thornton, J., Workman, J., Florens, L., Viswanath (…)2026-03-17
📄 systems biology

A stress-function tradeoff organizes epithelial heterogeneity across spatial scales in the human thyroid

मानव थायराइड ऊतक पर एक फॉलिकल-अवेयर (follicle-aware) स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स ढांचे को लागू करके, शोधकर्ताओं ने यह प्रकट किया है कि उपकला विषमता (epithelial heterogeneity) मुख्य रूप से हार्मोन संश्लेषण के विविधताओं के बजाय, सक्रिय हार्मोन-उत्पादक थायरोसाइट्स और स्थानिक रूप से क्लस्टर किए गए क्षति-प्रतिक्रिया कोशिकाओं के बीच एक तनाव-कार्य ट्रेडऑफ (stress-function tradeoff) द्वारा व्यवस्थित होती है।

Korem Kohanim, Y., Barkai, T., Novoselsky, R., Shir, S., Bahar Halpern, K., Reich-Zeliger, S., Elkahal, J., Tessler, I. (…)2026-03-16
📄 systems biology

The Female Biomarker Challenge: Sex-Specific Network Robustness Constrains Biological Age Estimation and Geroscience Trial Design

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि लिंग-विशिष्ट शारीरिक नेटवर्क सुदृढ़ता के लिए सटीक जैविक आयु अनुमान हेतु विशिष्ट बायोमार्कर पैनलों की आवश्यकता होती है, जो यह प्रकट करता है कि जहाँ वृद्ध पुरुष वर्तमान में लागत प्रभावी गेरोसाइंस परीक्षणों के लिए इष्टतम सिग्नल-टू-नॉइज़ अनुपात प्रदान करते हैं, वहीं अधिक महिला शारीरिक लचीलेपन से उत्पन्न चुनौतियों को दूर करने के लिए प्रमाणित महिला-विशिष्ट पैनल विकसित करना एक तत्काल प्राथमिकता है।

Harding, A. S., Coward, J., Tian, T.2026-03-16
📄 systems biology

Mathematical Modelling of the Mitochondrial Dicarboxylate Carrier (SLC25A10)

यह शोध पत्र पिंग-पोंग ढांचे और बायेसियन अनुमान (Bayesian inference) पर आधारित माइटोकॉन्ड्रियल डिकार्बोक्सिलेट कैरियर SLC25A10 का पहला ऊष्मागतिक रूप से सुसंगत, यांत्रिक रूप से व्युत्पन्न गणितीय मॉडल प्रस्तुत करता है, जो यह स्पष्ट करता है कि माइटोकॉन्ड्रियल आकृति विज्ञान और चयापचय संबंधी व्यवधान, विशेष रूप से SDH की कमी के तहत, सब्सट्रेट विनिमय और सक्सिनेट हैंडलिंग को कैसे नियंत्रित करते हैं।

Nashebi, R., Lyu, Y., Vera-Sigüenza, E., A. Tennant, D., Spill, F.2026-03-13
📄 systems biology

1100 Synthetic Benchmark Problems for Dynamic Modeling of Cellular Processes

यह शोध पत्र 22 प्रकाशित मॉडलों से व्युत्पन्न 1,100 सिंथेटिक बेंचमार्क समस्याओं के एक सार्वजनिक रूप से उपलब्ध संग्रह को प्रस्तुत करता है ताकि अच्छी तरह से क्यूरेट किए गए डेटासेट की कमी को दूर किया जा सके, जिससे कोशिकीय प्रक्रियाओं के गतिशील मॉडलिंग के लिए कम्प्यूटेशनल एल्गोरिदम का व्यवस्थित मूल्यांकन और अनुकूलन सक्षम हो सके।

Neubrand, N., Rachel, T., Litwin, T., Timmer, J., Kreutz, C., Hess, M.2026-03-13
📄 systems biology

Systems analysis reveals neuregulin-1 control of cardiomyocyte size and shape mediated by distinct PI3K and p38 pathways

उच्च-सामग्री रूपात्मक प्रोफाइलिंग (high-content morphological profiling), फॉस्फो-प्रोटीन एरेज़ और सिस्टम्स मॉडलिंग को एकीकृत करके, यह अध्ययन प्रकट करता है कि न्यूरेगुलिन-1 विशिष्ट PI3K और p38 सिग्नलिंग मार्गों के माध्यम से कार्डियोमायोसाइट दीर्घीकरण और क्षेत्र विस्तार को अनूठे रूप से संचालित करता है, जो दुर्भावनापूर्ण हृदय पुनर्निर्माण (maladaptive cardiac remodeling) को चुनिंदा रूप से लक्षित करने के लिए नए यांत्रिक अंतर्दृष्टि प्रदान करता है।

Luanpaisanon, P., Ryall, K. A., Tan, P. M., O'Hearn, J. J., Woo, L. A., Harris, B. N., Wissmann, B., Paap, A., Rhoads, M (…)2026-03-12
📄 systems biology

Detecting and Subtyping Ketoacidosis from Metabolomic Patterns in Forensic Casework

यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि वास्तविक स्वीडिश फॉरेंसिक मामलों पर मशीन लर्निंग के साथ पोस्टमॉर्टम मेटाबोलोमिक्स को एकीकृत करने से कीटोएसिडोसिस से संबंधित मृत्यु का सटीक पता लगाने और उपप्रकारों (सबटाइपिंग) को पहचानने में सक्षम बनाया जा सकता है, जिससे 90% से अधिक पहचान सटीकता और 80% से अधिक सबटाइपिंग सटीकता प्राप्त होती है।

Monte, R. E. C., Magnusson, R., Söderberg, C., Green, H., Elmsjö, A., Nyman, E.2026-03-12
📄 systems biology

GRNFormer: Accurate Gene Regulatory Network Inference Using Graph Transformer

GRNFormer एक सामान्यीकरण योग्य ग्राफ ट्रांसफार्मर फ्रेमवर्क है जो एक ट्रांसफार्मर-आधारित एक्सप्रेशन एनकोडर को एक वेरिएशनल ग्राफ ऑटोएनकोडर और ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर-एंकरड सैंपलिंग के साथ एकीकृत करके विविध प्रजातियों और कोशिका प्रकारों में सिंगल-सेल और बल्क ट्रांसक्रिप्टोमिक्स डेटा से जीन रेगुलेटरी नेटवर्क का सटीक अनुमान लगाता है, जो बेंचमार्क मूल्यांकन में मौजूदा विधियों से बेहतर प्रदर्शन करता है।

Hegde, A., Cheng, J.2026-03-11
📄 systems biology

Blood Biochemical Responses to Acute Exercise: Findings from the Molecular Transducers of Physical Activity Consortium (MoTrPAC)

यह अध्ययन तीव्र सहनशक्ति (endurance) और प्रतिरोध (resistance) व्यायाम के प्रति विशिष्ट और साझा सामयिक रक्त-आधारित आणविक प्रतिक्रियाओं को चित्रित करने के लिए गतिहीन मनुष्यों के बड़े पैमाने पर मल्टी-ओमिक्स प्रोफाइलिंग का उपयोग करता है, जो प्रतिरक्षा नियमन, लिपिड चयापचय और ऊतक मरम्मत जैसे प्रणालीगत स्वास्थ्य मार्गों में नवीन अंतर्दृष्टि प्रकट करता है।

Robbins, J. M., Katz, D. H., Many, G., Rao, P., Smith, G. R., Tiwari, G., Spielmann, G., Montalvo, S., Iyer, G., Amar, D (…)2026-03-11
📄 systems biology

Trans-acting Determinants of Gene Expression: Effects of Transcription Factor Affinity, Abundance, and Localization

यह अध्ययन व्यवस्थित रूप से प्रदर्शित करता है कि प्रमोटर बाइंडिंग-साइट की शक्ति जीन अभिव्यक्ति के स्तरों का प्राथमिक नियामक है, जिसके बाद ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर का स्थानीयकरण और सांद्रता आती है, जबकि एफिनिटी (आत्मीयता) में भिन्नताएं काफी हद तक बफ़र्ड (न्यूनीकरण) होती हैं, जो इन ट्रांस-एक्टिंग निर्धारकों के बीच प्रमुख प्रदर्शन संबंधी ट्रेड-ऑफ को प्रकट करती है।

Lopez-Malo, M., Maerkl, S. J.2026-03-11